Stallen die bijdragen aan dierenwelzijn, emissiereductie, kringlooplandbouw of innovatie in de Nederlandse landbouw, komen in aanmerking voor subsidie. De Milieu-investeringsaftrek biedt fiscaal voordeel voor bijvoorbeeld stallen die voldoen aan de Maatlat Duurzame Veehouderij (MDV). Daarnaast zijn er overheidsgelden voor kringlooplandbouw beschikbaar en NSP-subsidieregelingen voor modernisering en innovatie op het gebied van dierenwelzijn en emissiearme stalsystemen.